Les années 80 ont marqué le début d'un phénomène de conversion au wahhabisme dans le Caucase et l'Asie centrale. Les missionnaires viennent de pays tels que le Pakistan, la Turquie, l'Arabie Saoudite, l'Afghanistan et y prônent un islam radical. Tous les nouveaux pays apparus après la disparition de l'Union Soviétique sont concernés par cette islamisation qui prend désormais des allures de guérilla.

En 1992, des wahhabites tentent de créer une république islamique dans la vallée de Ferghana en Ouzbékistan et des attentats à la voiture piégée rappellent leurs ambitions à Tachkent, la capitale du pays, en février 1999. Les islamistes cherchent ensuite un appui au-delà de leurs frontières et c'est, le 23 août 1999, une prise d'otages au Kirghizstan où ils retiennent 16 personnes (voir carte). L'Ouzbékistan procède alors à des bombardements en territoire kirghize près de Kara-Tyeit le 29 août pour empêcher ces créations de bases arrières au Kirghizstan. Les effectifs des islamistes y sont de quelques centaines. Trois otages (des policiers kirghizes) ont été relâchés le 30 août mais 13 personnes restent retenues dont quatre géologues japonais.

Voir la description du Mouvement Islamique d'Ouzbékistan par l'armée des Etats Unis d'Amérique.